A principios de los años sesenta, cercano a finalizar sus estudios de antropología, viajó al desierto de Sonora en Mexico para recopilar información sobre los usos medicinales de ciertas plantas psicotrópicas o alucinógenas entre las etnias indígenas.Según sus libros, en la estación de autobuses de la Greyhound de un pueblo norteamericano fronterizo con México, mediante un antropólogo conocido de Carlos, conoció a un indio yaqui, a quien en sus libros se refiere con el seudónimo Don Juan Matus, que en menos de un año, y luego de frecuentes visitas por parte de Carlos, lo tomó como aprendiz. Don Juan, según Castaneda, era el líder de un grupo de brujos, el último de una larga tradición que se remontaba a los indios toltecas, que le enseñó los usos del peyote como psicotrópico (entre otros), teniendo así una sucesión de experiencias que incluyen columnas de luz cantarina, animales y otros seres que serían manifestaciones de poderes que un hombre sabio podría aprender a utilizar. Estos, entre otros, conocimientos propios del legado cultural conocido como "Tolteca".
En 1968 empieza a publicar sus libros sobre las enseñanzas de Don Juan, que son un éxito instantáneo.
Libro popular y polemico, "Las enseñanzas de don Juan" es el primer libro de una saga por entregas en las k narra el encuentro de un antropologo con un supuesto chaman yaqui, conocedor de plantas y trucos para adentrarse en un mundo magico e invisible, k se encuentra delante de nuestras narices.
Su popularidad se debe a la fenomenal capacidad literaria del autor y a la enorme amenidad de los libros. Y si una virtud hemos de encontrar a este libro, es k fueron tan populares durante los años 60, 70...k mucha gente tuvo el primer conocimiento de la existencia del peyote y los hongoscomo tambien su capacidad de abrir la percepcion al mundo magico.
Interesante prologo de Octavio Paz
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